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生物序列专利检索是生命科学领域中一种独特的检索类型，需要借助专业工具和行业知识来完成。在我们之前的网络研讨会中，Questel 公司的 Juliane Wissuwa 分享了生物序列专利检索的有效技术，并强调了选择专业检索工具的优势。以下是她演讲要点的总结。
生物序列是由单个连续的核酸或氨基酸分子组成，形成 DNA/RNA 或蛋白质，并携带生物体发育、功能、生长和繁殖的指令信息。生物序列中包含酶、抗体、激素、抑制剂分子以及基因修饰定位分子（如 CRISPR/Cas）等信息。它们在各行业和学术领域被广泛申请为专利，涵盖制药、生物技术、农用化学品、食品、酶制剂等行业，以及技术转让办公室（TTO）和研发机构。
这些专利不仅涵盖与药物相关的发明，如生物制剂、疫苗和药物，还包括诊断技术、生物催化剂（生物技术）、发酵技术、改良作物、动植物育种（农业）以及调味或增味剂分子（食品）等领域的创新。
然而，并不存在“标准”的生物序列专利，因为序列长度从几个残基到数百万个残基不等，专利可能仅涵盖一个小片段或整个基因组。
生物序列专利检索的独特挑战
尽管生物序列以连续的字母序列形式呈现（如上图所示），但在专利权利要求中，它们很少直接展示。通常，它们会被编号或展示在表格中（如下图所示，上部），或在附件中以表格或附录的形式引用。
此外，专利可以引用整个生物序列或其子序列，如下方示例所示，其中引用了特定的氨基酸残基：
最后，专利可能对生物序列提出权利要求，或仅为信息披露而公开。
如何在Orbit Intelligence中进行生物序列专利检索
Orbit BioSequence是一种用于比较序列相似性的专用工具。如下图所示，它允许用户检索 FASTA 格式的生物序列（核酸或氨基酸），在多次检索中使用相同的序列类型，并根据特定生物序列调整检索参数，包括：
- 检索式长度：长/短/基序；
- 合适的数据库：核苷酸数据库或蛋白质数据库，或两者兼用，以获得最详尽的结果；
- 主题序列长度：限定长度以查找短序列作为引物（因为您可能无需检索整个基因组信息）。
如果检索结果数量较少，您可以手动审查。然而，许多生物序列专利检索会生成数百甚至数千条结果，因此Orbit BioSequence配备了专业过滤器，帮助消除干扰并精简或聚焦结果。
- 生物序列过滤器支持根据检索式或主题的匹配百分比、错误或缺口数量、主题或对齐长度进行筛选，同时可将检索范围限定在权利要求部分，从而仅展示对序列提出权利要求（而非引用）的专利。
- 专利过滤器可帮助您根据法律状态、申请年份和公开国家进行筛选，为自由实施检索提供支持。这样，您无需在全球范围内检索即可找到相同或相似的序列。
- 相关性过滤器允许您按关键词（语义）、国际专利分类（IPC）号、专利权人进行检索，甚至可提取涉及诉讼、异议、许可等的专利。
- 高级检索功能支持将生物序列检索与关键词检索相结合，在减少干扰的同时，确保保留有价值的生物序列信息。
